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BD Rhapsody 助力單細胞測序研究

更新時間:2021-07-13

閱讀:2914

 單細胞測序技術自2009年問世,2013年被Nature Methods評為年度技術以來,越來越多地被應用在科研領域。自此,單細胞測序技術被廣泛應用于基礎科研和臨床研究

   單細胞在許多領域都占有一席之地,對于癌癥早期的診斷、追蹤以及個體化治療具有重要意義。

 

 

 

 

基本原理

 

 

   單細胞測序首先不是僅僅對一個細胞進行測序,而是說該項技術能對單一細胞的基因組或轉錄組進行測序,可以理解為單細胞水平上的測序。

   為什么要進行單細胞測序?世界上沒有兩片相同的葉子,對于多細胞生物來說細胞與細胞之間是存在差異的,很多時候是基因組、轉錄組上的失之毫厘,功能上的差之千里。比如在腫瘤組織中,腫塊中心的細胞與腫塊周圍的細胞,原發灶與轉移灶的細胞,其基因組與轉錄組等遺傳信息是存在差異的,這也就導致不同腫瘤細胞表現出免疫特性、生長速度、侵襲能力等表型方面的差異,最終導致對不同抗腫瘤藥物的敏感性不同或放療敏感性的差異。
   傳統測序方法所展示的信息也是在多細胞水平上的平均信息,而單細胞水平上的測序則*可以反應同一個細胞群里不同細胞的基因組和轉錄組狀況。單細胞測序技術的出現,使得從混雜的樣品中篩選出異質性信息的難題得以解決,該技術的成熟使用也必將生命科學研究向前邁進一大步

 

 

 

 

BD Rhapsody

 
 

   BD Rhapsody™單細胞分析系統應運而生,此系統的誕生基于 BD 在細胞生物學領域 40年的專業技術,克服了傳統檢測的局限性,能夠對成千上萬個單細胞的數百個表達基因同時進行數字定量,每個細胞提取獨立數據,體現異質性,可以鑒定和表征新型和罕見細胞類型,有助于理解從免疫學到腫瘤學等多個領域內的生物學過程。

 

  BD重磅推出的Rhapsody™單細胞分析系統克服了傳統檢測的局限性,如微陣列和大量細胞 RNAseq,傳統檢測依賴于對多個細胞的平均檢測,來實現對細胞間微妙差異的觀察。與其他單細胞分析系統相比,BD Rhapsody™的特點及優勢在于:

 

1.更高的采樣靈敏度

靶向分析方法有助于提高單細胞測序效率,Rhapsody系統提供的檢測試劑盒(panel)可穩定的重現細胞異質性的數據,可用于探索與眾多應用相關的細胞類型。且與全轉錄組擴增的mRNA分析相比,Rhapsody系統對罕見轉錄有更低的檢測閾值。

 

2.克服 PCR 偏差 — BD分子標簽

當對序列讀取進行計數時,PCR 擴增偏差可導致基因定量不準確。Rhapsody采用“分子標簽”技術,能為單細胞中每個轉錄本標記特異性分子標簽,實現了單細胞水平上基因表達譜的絕對定量,同時,每個細胞也會被標記特異性細胞標簽,這使高通量平行建庫成為可能。

 

3.單細胞成像系統

對單細胞分離過程進行質控,監控細胞存活率、單細胞分離效率,有效保證實驗成功率。

 

4.更高的轉錄本檢測特異性

系統通過*的數據分析流程,去除PCR錯誤擴增產物,降低細胞非特異性表達水平。

 

5.更高的分辨率

可以分辨更細分、微觀的細胞群和細胞亞種群。

 

6.更經濟的測序和設備預算

結合Rhapsody*的單細胞分離技術,單次實驗可制備100-10000個單細胞文庫,用戶可根據需求定制引物,將檢測范圍集中在目標基因,大幅降低后續測序成本。

 

 

   隨著人們逐漸意識到單細胞研究對認識人自身以及疾病的重要性,單細胞測序技術的誕生恰逢其時。目前單細胞測序已經廣泛用于微生物學、神經學、人體發育、免疫、癌癥、輔助生殖等領域的研究。相信此次BD Rhapsody單細胞分析系統的閃亮登場,能夠為目前高速發展中的精準醫學帶來濃墨重彩的一筆。

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