BD Rhapsody 助力單細(xì)胞測序研究

 單細(xì)胞測序技術(shù)自2009年問世，2013年被Nature Methods評為年度技術(shù)以來，越來越多地被應(yīng)用在科研領(lǐng)域。自此，單細(xì)胞測序技術(shù)被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)科研和臨床研究。

   單細(xì)胞在許多領(lǐng)域都占有一席之地，對于癌癥早期的診斷、追蹤以及個(gè)體化治療具有重要意義。

   單細(xì)胞測序首先不是僅僅對一個(gè)細(xì)胞進(jìn)行測序，而是說該項(xiàng)技術(shù)能對單一細(xì)胞的基因組或轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序，可以理解為單細(xì)胞水平上的測序。

   為什么要進(jìn)行單細(xì)胞測序？世界上沒有兩片相同的葉子，對于多細(xì)胞生物來說細(xì)胞與細(xì)胞之間是存在差異的，很多時(shí)候是基因組、轉(zhuǎn)錄組上的失之毫厘，功能上的差之千里。比如在腫瘤組織中，腫塊中心的細(xì)胞與腫塊周圍的細(xì)胞，原發(fā)灶與轉(zhuǎn)移灶的細(xì)胞，其基因組與轉(zhuǎn)錄組等遺傳信息是存在差異的，這也就導(dǎo)致不同腫瘤細(xì)胞表現(xiàn)出免疫特性、生長速度、侵襲能力等表型方面的差異，最終導(dǎo)致對不同抗腫瘤藥物的敏感性不同或放療敏感性的差異。
   傳統(tǒng)測序方法所展示的信息也是在多細(xì)胞水平上的平均信息，而單細(xì)胞水平上的測序則*可以反應(yīng)同一個(gè)細(xì)胞群里不同細(xì)胞的基因組和轉(zhuǎn)錄組狀況。單細(xì)胞測序技術(shù)的出現(xiàn)，使得從混雜的樣品中篩選出異質(zhì)性信息的難題得以解決，該技術(shù)的成熟使用也必將生命科學(xué)研究向前邁進(jìn)一大步

   BD Rhapsody™單細(xì)胞分析系統(tǒng)應(yīng)運(yùn)而生，此系統(tǒng)的誕生基于 BD 在細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域 40年的專業(yè)技術(shù)，克服了傳統(tǒng)檢測的局限性，能夠?qū)Τ汕先f個(gè)單細(xì)胞的數(shù)百個(gè)表達(dá)基因同時(shí)進(jìn)行數(shù)字定量，每個(gè)細(xì)胞提取獨(dú)立數(shù)據(jù)，體現(xiàn)異質(zhì)性，可以鑒定和表征新型和罕見細(xì)胞類型，有助于理解從免疫學(xué)到腫瘤學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域內(nèi)的生物學(xué)過程。

  BD重磅推出的Rhapsody™單細(xì)胞分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測的局限性，如微陣列和大量細(xì)胞 RNAseq，傳統(tǒng)檢測依賴于對多個(gè)細(xì)胞的平均檢測，來實(shí)現(xiàn)對細(xì)胞間微妙差異的觀察。與其他單細(xì)胞分析系統(tǒng)相比，BD Rhapsody™的特點(diǎn)及優(yōu)勢在于：

1.更高的采樣靈敏度

靶向分析方法有助于提高單細(xì)胞測序效率，Rhapsody系統(tǒng)提供的檢測試劑盒（panel）可穩(wěn)定的重現(xiàn)細(xì)胞異質(zhì)性的數(shù)據(jù)，可用于探索與眾多應(yīng)用相關(guān)的細(xì)胞類型。且與全轉(zhuǎn)錄組擴(kuò)增的mRNA分析相比，Rhapsody系統(tǒng)對罕見轉(zhuǎn)錄有更低的檢測閾值。

2.克服 PCR 偏差 — BD分子標(biāo)簽

當(dāng)對序列讀取進(jìn)行計(jì)數(shù)時(shí)，PCR 擴(kuò)增偏差可導(dǎo)致基因定量不準(zhǔn)確。Rhapsody采用“分子標(biāo)簽”技術(shù)，能為單細(xì)胞中每個(gè)轉(zhuǎn)錄本標(biāo)記特異性分子標(biāo)簽，實(shí)現(xiàn)了單細(xì)胞水平上基因表達(dá)譜的絕對定量，同時(shí)，每個(gè)細(xì)胞也會(huì)被標(biāo)記特異性細(xì)胞標(biāo)簽，這使高通量平行建庫成為可能。

3.單細(xì)胞成像系統(tǒng)

對單細(xì)胞分離過程進(jìn)行質(zhì)控，監(jiān)控細(xì)胞存活率、單細(xì)胞分離效率，有效保證實(shí)驗(yàn)成功率。

4.更高的轉(zhuǎn)錄本檢測特異性

系統(tǒng)通過*的數(shù)據(jù)分析流程，去除PCR錯(cuò)誤擴(kuò)增產(chǎn)物，降低細(xì)胞非特異性表達(dá)水平。

5.更高的分辨率

可以分辨更細(xì)分、微觀的細(xì)胞群和細(xì)胞亞種群。

6.更經(jīng)濟(jì)的測序和設(shè)備預(yù)算

   隨著人們逐漸意識到單細(xì)胞研究對認(rèn)識人自身以及疾病的重要性，單細(xì)胞測序技術(shù)的誕生恰逢其時(shí)。目前單細(xì)胞測序已經(jīng)廣泛用于微生物學(xué)、神經(jīng)學(xué)、人體發(fā)育、免疫、癌癥、輔助生殖等領(lǐng)域的研究。相信此次BD Rhapsody單細(xì)胞分析系統(tǒng)的閃亮登場，能夠?yàn)槟壳案咚侔l(fā)展中的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)帶來濃墨重彩的一筆。